N-BIO BINDS

PreDom:DiDについて

SCOP または CATH に定義されているドメインに基づいてタンパク質の立体構造を分割し、ドメインとドメインの相互作用面をAccessible Surface Area (ASA) の差 (Δ ASA > 1 Å2) に基づいて同定した結果を収集したデータベースです。

DiDでは、ドメイン-ドメイン相互作用面の中で、分割前のタンパク質立体構造においては内部に埋まっており (relative ASA < 0.1) 、 ドメインに分割すると表面に露出する相互作用残基をコア相互作用残基と定義し、それ以外の周辺相互作用残基と区別して表示しています。


Database SCOP CATH
Data ID [PDB ID]:  [chain]:  

Sample PDB entry

  • [PDBID] 1pii  [chain] A